水生植物是湖泊生态系统的重要组成，包括沉水植物、挺水植物等。邛海地处中国西南地区，是周边城市的饮用水源地和国家级风景名胜区的核心区。下图示意夏季邛海水生植物的分布。冬季，该湖水生植物分布范围比夏季小，且多集中于河口处。1998年流域暴雨导致邛海水生植物减少，分布水深变浅、范围缩小，沉水植物分布范围缩小尤为明显。为此，当地着力改善水生植物生境，维护邛海环境安全。

流石滩是植物能够抵达的上限，其环境异常恶劣，只有少数物种经受住了这样的环境。流石滩上并没有太强的种内竞争和种间竞争，这里分布的垫状植物具有紧贴地面、周身被毛的特点，根系向纵深发展或平行发展的横走根，外层致密的枝叶，叶片呈现出紫红色。下图为垫状植物景观图。

高海拔盆地泥炭层被誉为古气候研究的理想档案。泥炭层由泥炭和少量泥沙构成。泥炭是沼泽形成过程中的必然产物，其物质主要是沼泽生物残体。泥炭腐殖质数量主要受控于土壤温度、湿度和微生物活动能力，可用于指示古气候。下表示意两类区域泥炭的相关资料。